Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cttnbp2B9EJA2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cttnbp2B9EJA2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms