Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp42B2RQC2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms