Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Gm6880A3KG45 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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