Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Scn3aA2ASI5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Scn3aA2ASI5 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms