Protein–RNA interactions for Protein: A2ALC6

Gm4985, MCG8129, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4985A2ALC6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm4985A2ALC6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm4985A2ALC6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms