Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Prdm12A2AJ77 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms