Protein–RNA interactions for Protein: A2AEN9

Gm5938, Predicted gene 5938, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5938A2AEN9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm5938A2AEN9 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm5938A2AEN9 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms