Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
PtprfA2A8L5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
PtprfA2A8L5 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms