Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms