Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Pfdn5Q9WU28 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Pfdn5Q9WU28 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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