Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SLC12A4Q9UP95 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms