Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Col5a3Q9JLI2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Col5a3Q9JLI2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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