Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tlr5Q9JLF7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms