Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Scamp5Q9JKD3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms