Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf6Q9DBU5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Rnf6Q9DBU5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Rnf6Q9DBU5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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