Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pdzd9Q9D9M4 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms