Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ttc9bQ9D6E4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ttc9bQ9D6E4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms