Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Pabpc6Q9D4E6 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pabpc6Q9D4E6 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms