Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Snapc3Q9D2C9 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms