Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Atxn3Q9CVD2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atxn3Q9CVD2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Atxn3Q9CVD2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atxn3Q9CVD2 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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