Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chmp3Q9CQ10 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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