Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rab28Q99KL7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms