Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Atl3Q91YH5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atl3Q91YH5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms