Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Sh3bgrl3Q91VW3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms