Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Cacng8Q8VHW2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms