Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Nup35Q8R4R6 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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