Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Trim68Q8K243 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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