Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
SbsnQ8CIT9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SbsnQ8CIT9 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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