Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Tspan9Q8BJU2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms