Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Jmjd4Q8BFT6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms