Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ttc29Q80VM3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms