Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tmeff1Q6PFE7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tmeff1Q6PFE7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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