Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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