Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Jmjd1cQ69ZK6 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms