Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Sbno1Q689Z5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sbno1Q689Z5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms