Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ecm1Q61508 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ecm1Q61508 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Ecm1Q61508 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ecm1Q61508 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms