Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ift88Q61371 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ift88Q61371 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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