Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Cln3Q61124 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cln3Q61124 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms