Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Usf1Q61069 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Usf1Q61069 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Usf1Q61069 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms