Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Grik1Q60934 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Grik1Q60934 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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