Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

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Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Rnf123Q5XPI3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf123Q5XPI3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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