Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Usp48Q3V0C5 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp48Q3V0C5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms