Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Capn13Q3UW68 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Capn13Q3UW68 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms