Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Nlrc4Q3UP24 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms