Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Fam35aQ3UEN2 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms