Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RubcnlQ3TD16 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
RubcnlQ3TD16 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms