Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Prr27Q3SYJ2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Prr27Q3SYJ2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms