Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl9Q32KG4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rtl9Q32KG4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rtl9Q32KG4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rtl9Q32KG4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Rtl9Q32KG4 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Rtl9Q32KG4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rtl9Q32KG4 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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