Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpusd2Q149F1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms