Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Rbp2Q08652 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rbp2Q08652 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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